新国标将指标由原来的106项调整为97项，分为常规指标43项 + 扩展指标54项，另有附录中的水质参考指标55项。新增了高氯酸盐、乙草胺、2-甲基异莰醇、土臭素4项，删除了耐热大肠菌群、滴滴涕等13项。
微生物指标：菌落总数、总大肠菌群、大肠埃希氏菌等——判断有没有被粪便/病原污染，是最核心的安全指标。
消毒剂指标：游离氯、二氧化氯、臭氧余量等——保证消毒有效。
毒理指标：砷、镉、铬（六价）、铅、汞、硒、氰化物、氟化物、硝酸盐，以及三氯甲烷、氯酸盐、溴酸盐等消毒副产物和有机污染物——控制长期健康风险。
感官性状和一般化学指标：色度、浑浊度、臭和味、肉眼可见物、pH、铝铁锰铜锌、氯化物、硫酸盐、溶解性总固体、总硬度、氨（以N计）、高锰酸盐指数等——决定水"看起来、喝起来怎么样"。
放射性指标：总α放射性、总β放射性。
常规指标（43项）反映饮用水基本水质状况，各地都必须检；扩展指标（54项）反映地区性特征或特殊情况（如当地有化工企业、特定水源污染风险时才加测）。